常见的固相萃取设备可分为自动固相萃取仪和手动固相萃取装置。手动固相萃取装置又可分为负压型和正压型两大类。传统的固相萃取装置是以真空负压为动力源使载入固相萃取柱的液体通过固相萃取柱。负压型固相萃取装置简单，但由于这种装置难以控制液体通过固相萃取柱的流速，而且平行操作时柱与柱之间的流速差异较大。与之相反，正压型固相萃取装置采用的是氮气或空气作为液体通过固相萃取柱的动力源。由于正压型固相萃取装置压力平稳，流速容易控制，近年来收到实验室工作人员的欢迎。