C18色谱柱选用的基本原则：
（1）选用经过烷基化处理封口的填料可防止碱性化合物的拖尾现象。
（2）选用含碳量高的柱子，增加保留值。
（3）选用较短的柱子。
（4）选用小颗粒度的填料。
（5）对分子量大的组分选用大孔径填料的柱子。
C18色谱柱在日常使用过程中应注意的事项：
（1）柱子在装卸、更换时，动作要轻，接头拧紧要适度。必须防止较强的机械振动，以免柱床产生空隙。
（2）如果仪器用来做常规分析，样品种类有限，但分析次数多，则不妨为每一类常规分析配置1根专用柱，这样有助于延长柱子的寿命。
（3）如使用柱温控制装置时，应注意在通入流动相后才能升温。
（4）流动相使用前需进行脱气处理，以免降低柱效和影响检测等。样品溶液需经适当的前处理及过滤，以减少柱污染和堵塞。
（5）在更换流动相种类时，应注意溶剂的互溶性，防止发生盐析现象。
（6）柱子的实际操作压力应低于填装时的较高压力，在高压力一半以下。
（7）属非极性键合相色谱柱，流动相的pH值应严格控制在一定区间之间，以免损坏柱子。
（8）在完成分离分析工作之后，不应立即停机，需及时对色谱分析系统进行冲洗，以除去色谱柱内的杂质。
（9）如果流动相中有盐类，首先用水充分清洗。如果是胺类添加到流动相中，要用甲醇和磷酸溶液混合溶剂冲洗，不要只用水冲洗。
（10）C18一般用甲醇作为保存溶剂，以防柱子干裂而损坏。严禁水或缓冲溶液长时间在色谱流路中保留。
（11）选用合适的C18保护柱，以保护分析柱免受杂质颗粒及不可逆吸附的干扰物的影响。保护柱内装填料颗粒度应与分析柱填料的颗粒度尽量一致。
