苯基色谱柱具有苯基官能团π电子色谱柱。对诸如芳香族化合物分离，除疏水性相互作用外，还有固定相和溶质之间π-π电子间相互作用的帮助，因此显示出不同于包含ODS在内的烷基硅胶基质固定相的分离特性。
可以提供互补的分离选择性，特别适合于带有芳香环的化合物分离。杂化颗粒技术与色谱柱的结合，使该固定相具有很好的pH稳定性、优化的表面覆盖率、对所有类型化合物的优异色谱峰形，以及高重现性的保留时间。此外，双点键合的短链苯基配体还提高了低pH条件下键合相的耐水解稳定性。填料基质与配体技术的*结合为复杂混合物的分离提供了又一个选择性调节的新工具。
苯基色谱柱不能用纯水冲洗的原因有以下几点：
先是色谱柱的方向问题。大多数色谱柱会标明方向。这个大家都知道，安装的时候要顺着方向安装。不过也有一些色谱柱没有方向，这些是双相填料的色谱柱。第一次使用时的方向就是它的方向。不过所有的色谱柱都是，一旦开始使用，就不要转换方向。这样会损毁色谱柱。
然后是柱压问题。一般的色谱柱压力不要超过20MPa，压力过高会加速损毁色谱柱。
接着是柱温。色谱柱温度不要超过45℃。也是会加速损毁色谱柱。
还有pH值。色谱柱的pH值范围是不同的。大多数色谱柱的pH值范围是4-7左右。有些偏向酸性，有些偏向碱性的，还有一些pH值广泛的。这些按照说明书操作即可。
除此之外，色谱柱还有别的一些需要注意的事情。
