GPC 色谱柱以苯乙烯- 二乙烯基苯共聚物为填料的有机相凝胶柱，尺寸排阻分离模式，适合进行有机溶剂系的有机物、低聚物的分离，对高分子物质的分子量分布测试也很适用。
但是在使用过程中难免会出现故障，以下是出现常见故障之后的解决办法。
校正曲线注意事项
曲线拟合形状通常选择五次方拟合。近几年的研究表明，对校正GPC柱来说，这种拟合方式被认为是较好的，因为它很接近柱子的实际情况，标曲点数少于10个可以选择三次方拟合。
聚合物样品制备注意事项
聚合物溶液越稀越好，这样可以防止粘度效应和保留时间不重现的现象。稀溶液可以允许聚合物充分展开，进入最松弛的构造，无链纠缠，不形成微胶。进样体积：小于100 μL/每根色谱柱(7.8 mm ID)。
做GPC的流动相要尽量使用色谱纯试剂，其他能过滤的溶剂或液体尽可能过滤；在有柱子的时候尽量不要把气泡带进。
■ 使用THF时：
需要注意溶剂中水含量及过氧化物的含量。水和过氧化物含量过高，会降低色谱柱寿命和结果的重现性。新购买的THF通常含有稳定剂(抗氧剂)，这种THF经过滤即可使用。抗氧剂的存在可以抑制THF中过氧化物的可能生成，从而减少过氧化物对系统的可能侵害，延长密封垫寿命。
■ 使用DMF时：
有时需要添加50 mM的LiBr以消除电荷效应，并且要严格除水。
■ 使用氯离子体系时：
由于氯离子对管路有腐蚀作用，因此需要将管路钝化。
■ 水相GPC体系：
盐也可以用于水相GPC，因为色谱柱中的甲基丙烯酸凝胶带有负电荷。由于填料带有负电荷会与阴离子样品发生离子排斥，与阳离子样品发生离子吸附。使用钠盐，可以大幅度减小这些影响，以及当与阳离子样品发生任何离子交换作用时减少对洗脱液pH值的调整。
