极性改性色谱柱在使用高水相分离极性化合物时易发生孔内去湿现象，提供了可替代选择。能够有效保留各类极性化合物，并改善极性化合物的色谱峰形，尤其是对碱性化合物的拖尾而言，具有明显改善作用。
极性改性色谱柱的平衡：
由工厂测试后是保存在乙腈/水中的。
请一定确保分析样品所使用的流动相和乙腈/水互溶。每天用足够的时间以流动相来平衡色谱柱，您就会在处理问题方面获得最大的"补偿"，而且色谱柱的寿命也会变得更长！操作步骤：
a、平衡开始时将流速缓慢地提高，用流动相平衡色谱柱直到获得稳定的基线（缓冲盐或离子对试剂流速如果较低，则需要较长的时间来平衡）。
b、如果使用的流动相中含有缓冲盐，应注意用纯水"过渡"即每天分析开始前必须先用纯水冲洗30分钟以上再用缓冲盐流动相平衡；分析结束后必须先用纯水冲洗30分钟以上除去缓冲盐之后再用甲醇冲洗30分钟保护柱子。
长期保存极性改性色谱柱：
如色谱柱要长时间保存，必须存于合适的溶剂下。对于反相柱可以储存于纯甲醇或乙腈中，正相柱可以储存于严格脱水后的纯正己烷中，离子交换柱可以储存于水中，并将购买时附送的堵头堵上。储存的温度最好是室温。
在使用中常见的问题：就是柱压升高，如果柱压是在长时间使用过程中缓慢增加，属于正常现象。但柱压在使用过程中突然升高（系统管路堵塞及压力传感器故障除外），可能的原因有如下几点：
（1）过滤筛板堵塞或污染；
（2）填料被样品污染；
（3）色谱柱内缓冲液中的盐遇到高浓度的甲醇或其他有机溶剂，形成结晶析出；
（4）流动相pH值过大或过小使固定相结构破坏或溶解。
